別のECサービスでつかっている独自ドメインを、カゴラボ移行と同時に使いたい

はい、そのような対応も数多く経験しておりますので、お任せ下さい。

その場合、既存のサイトは移行ギリギリまで運営しておきたいと思われると思いますが、
カゴラボは設置ドメインさえ決まれば先行して構築が可能ですので、事前に弊社営業までご相談下さい。